Zoho Books vs bexio vs sevDesk: Buchhaltung für Schweizer KMUs (2026)

Zoho Books, bexio und sevDesk im ehrlichen Vergleich: Preise, Schweizer MWST, QR-Rechnungen und Suite-Effekt. Welche Buchhaltungslösung passt zu deinem KMU?

Buchhaltung ist für die meisten KMU-Inhaber ein notwendiges Übel. Du willst Rechnungen schreiben, Ausgaben tracken, den Bankabgleich machen und am Jahresende dem Treuhänder eine saubere Datei schicken. Nicht mehr, nicht weniger.

Im DACH-Raum konkurrieren drei Lösungen um diese Aufgabe: bexio als Schweizer Platzhirsch, sevDesk als günstiger deutscher Herausforderer und Zoho Books als Teil einer globalen Business-Suite. Jede hat ihre Stärken, jede ihre Schwächen. Und jede erzählt dir natürlich, sie sei die beste.

In diesem Vergleich bin ich ehrlich — auch über Zohos Grenzen. Denn bei Buchhaltung geht es nicht um Features, sondern darum, ob dein Treuhänder am Jahresende zufrieden ist.

bexio: Der Schweizer Standard

bexio ist das, was die meisten Schweizer KMUs nutzen. Und das hat gute Gründe: Schweizer Hosting, QR-Rechnungen nach ISO 20022, MWST-Handling nach Schweizer Recht, und praktisch jeder Treuhänder im Land kennt das System.

Aber bexio wird teurer. Ab März 2026 steigen die Preise deutlich. Der bisherige Starter-Plan (CHF 35/Mo) wird zum „Advanced”-Plan für CHF 42/Mo — das sind 20% mehr. Wer auf dem alten Preis bleiben will, bekommt nur noch den neuen „Basic”-Plan, der keine Bankanbindung und keine Ausgabenverwaltung mehr hat. Damit ist Basic praktisch nur noch ein Rechnungstool.

bexio-Plan	Preis/Mo	Highlights	Einschränkungen
Basic (NEU)	CHF 35	Rechnungen, Kontakte	Keine Bank, keine Ausgaben
Advanced	CHF 42	Bank, Ausgaben, 50 Belege, 2 User	Keine Lohnbuchhaltung
Optima	CHF 69	Lohn, Projekte, 5 User	Kein Lager, keine API
Ultimate	CHF 119	Alles, unbegrenzte User	Teuer für kleine Teams

Für ein typisches KMU mit 3-5 Mitarbeitenden, das Bankabgleich und Ausgabenverwaltung braucht, zahlst du mindestens CHF 42/Mo. Will dein Team mit mehreren Usern arbeiten und Projekte abrechnen, sind es CHF 69/Mo.

sevDesk: Günstig, aber für die Schweiz geeignet?

sevDesk ist in Deutschland extrem beliebt und taucht auch in Schweizer Vergleichen regelmässig auf. Der Preis ist verlockend: Ab 12,90 Euro pro Monat bekommst du Rechnungen, ab 17,90 Euro auch Buchhaltung mit Bankabgleich.

Aber hier kommt der Haken: sevDesk ist auf deutsches Steuerrecht optimiert. Die EÜR (Einnahmenüberschussrechnung) ist ein deutsches Konzept, das es in der Schweiz nicht gibt. Die USt-Voranmeldung läuft über ELSTER — ein deutsches System, das in der Schweiz irrelevant ist. QR-Rechnungen nach Schweizer Standard sind nur eingeschränkt möglich.

Wenn du als Schweizer Unternehmen mit sevDesk arbeitest, musst du vieles manuell anpassen. Dein Treuhänder wird dir wahrscheinlich ein skeptisches Gesicht machen. Und bei einer MWST-Prüfung willst du keine Software, die „irgendwie auch für die Schweiz geht”.

Für deutsche und österreichische Unternehmen ist sevDesk eine hervorragende Wahl. Für die Schweiz rate ich davon ab — es sei denn, du bist Freelancer mit sehr einfachen Anforderungen und brauchst nur Rechnungen.

Zoho Books: Die globale Alternative

Zoho Books ist eine vollwertige Cloud-Buchhaltung: Rechnungen, Ausgaben, Bankabgleich, Projekte, Lager, Multi-Währung und Automatisierungen. Die Oberfläche ist modern, die API offen, und die Integration mit dem Zoho-Ökosystem ist nahtlos.

Als Standalone-Produkt kostet Zoho Books zwischen 0 Euro (Free, 1 User) und 29 Dollar pro Monat (Professional). Aber der eigentliche Clou ist Zoho One: Für 37 Euro pro User bekommst du Zoho Books plus Zoho CRM, Zoho Desk, Zoho Projects, Zoho Campaigns, Zoho SalesIQ und über 35 weitere Apps.

Jetzt die ehrliche Einschränkung: Zoho Books ist nicht perfekt für die Schweiz. Die MWST-Sätze lassen sich konfigurieren, aber das Schweizer MWST-Abrechnungsformular ist nicht nativ eingebaut. QR-Rechnungen funktionieren, brauchen aber initiale Konfiguration. Und nicht jeder Schweizer Treuhänder kennt Zoho Books — bei bexio nicken sie sofort.

Der ehrliche Preisvergleich

Lass uns die Kosten für ein typisches Schweizer KMU mit 5 Mitarbeitenden vergleichen — realistisch, nicht nur die Grundpreise.

Szenario: 5-User-Team, braucht Rechnungen + Bankabgleich + Ausgaben

bexio Advanced: CHF 42/Mo (2 User inkl.) + CHF 15/Mo pro weiterem User × 3 = CHF 87/Mo. Nur Buchhaltung. Kein CRM, kein Helpdesk, kein Marketing.

sevDesk Buchhaltung Pro: 27,90 €/Mo für 1 User. Zusätzliche User kosten extra. Für ein 5-User-Team: ca. 60-80 €/Mo. Aber: Schweizer Compliance fehlt. Du brauchst trotzdem ein separates Tool für QR-Rechnungen oder manuellen Aufwand.

Zoho Books (Standalone): Professional für ca. 29 $/Mo. Für 5 User erweitert: ca. 50-70 €/Mo. Funktional vergleichbar mit bexio, aber weniger Schweiz-spezifisch.

Zoho One: 5 × 37 € = 185 €/Mo. Das klingt mehr als bexio — aber du bekommst nicht nur Buchhaltung, sondern CRM, Helpdesk, Projektmanagement, Marketing-Automation, HR und 35+ weitere Apps. Rechne den Preis der Tools zusammen, die du neben bexio brauchst, und Zoho One ist fast immer günstiger.

💡 Suite-Rechnung: bexio Advanced (CHF 87) + Pipedrive CRM (5 × 39 € = 195 €) + Freshdesk (75 €) = ca. CHF 370/Mo. Zoho One: CHF 185/Mo. Du sparst die Hälfte und hast ein integriertes System.

Wann bexio die richtige Wahl ist

bexio ist die beste Wahl, wenn Schweizer Compliance deine Top-Priorität ist. Wenn dein Treuhänder bexio nutzt und du direkte Zusammenarbeit brauchst, ist die Entscheidung einfach. Die Treuhänder-Schnittstelle von bexio ist ein echtes Alleinstellungsmerkmal — dein Treuhänder sieht deine Daten in Echtzeit und kann direkt im System arbeiten.

Auch für Unternehmen, die primär eine Buchhaltungslösung brauchen und keine umfassende Business-Suite, ist bexio solide. Die Lohnbuchhaltung ab dem Optima-Plan ist für Schweizer Verhältnisse gut umgesetzt (AHV, BVG, Quellensteuer).

Und die Schweizer QR-Rechnung funktioniert bei bexio einwandfrei — das ist keine Selbstverständlichkeit.

Wann sevDesk die richtige Wahl ist

Für deutsche und österreichische Unternehmen ist sevDesk preis-leistungsmässig kaum zu schlagen. Die EÜR-Automatisierung, die ELSTER-Anbindung und die GoBD-Konformität sind perfekt für den deutschen Markt.

Auch für Schweizer Freelancer, die nur Rechnungen an deutsche Kunden schreiben und keine komplexe Buchhaltung brauchen, kann sevDesk funktionieren. Aber für Schweizer KMUs mit echten Buchhaltungsanforderungen? Lieber nicht.

Wann Zoho Books (und Zoho One) die richtige Wahl ist

Zoho Books allein ist für die Schweiz eine solide, aber nicht überlegene Wahl. Der wahre Mehrwert entsteht im Kontext von Zoho One.

Wenn du ein wachsendes KMU hast, das neben Buchhaltung auch CRM, Marketing, Support und Projektmanagement braucht, ist Zoho One die wirtschaftlichste Lösung. Du zahlst einen Preis und bekommst alles. Die Buchhaltung in Zoho Books ist funktional gleichwertig mit bexio für die meisten Anwendungsfälle. Die Rechnung aus Zoho CRM fliesst automatisch in Zoho Books, der Zahlungseingang wird getrackt, und Zoho Analytics zeigt dir übergreifende Business-KPIs.

Für international tätige Unternehmen ist Zoho Books sogar überlegen: Multi-Währung, automatische Wechselkurse und Rechnungen in beliebigen Sprachen sind Standard.

Die Hybrid-Strategie: bexio + Zoho One

Viele meiner Kunden fahren eine Hybrid-Strategie: bexio für die Schweizer Buchhaltung, Zoho One für alles andere. Das funktioniert überraschend gut.

Die Buchhaltung läuft über bexio — mit Treuhänder-Zugriff, QR-Rechnungen und MWST-Abrechnung. Der Vertrieb nutzt Zoho CRM. Marketing läuft über Zoho Campaigns und Zoho SalesIQ. Support über Zoho Desk. Die Verbindung zwischen bexio und Zoho läuft über Zapier oder die APIs beider Systeme.

Ein Handelsunternehmen aus Aargau fährt genau dieses Setup seit einem Jahr. Rechnungen werden in bexio erstellt (wegen QR-Code und Treuhänder), aber die Kundendaten und der Vertriebsprozess laufen komplett über Zoho CRM. Der Datenaustausch läuft automatisch — neue Kunden in Zoho CRM werden in bexio synchronisiert, und Zahlungsstatus fliesst zurück.

Fazit: Es hängt von deinem Kontext ab

bexio gewinnt bei Schweizer Compliance, Treuhänder-Integration und QR-Rechnungen. Wenn Buchhaltung dein Hauptproblem ist und du in der Schweiz operierst, ist bexio die sicherste Wahl.

sevDesk gewinnt beim Preis in Deutschland und Österreich. Für die Schweiz ist es nur bedingt geeignet.

Zoho Books / Zoho One gewinnt beim Gesamtpaket. Wenn du neben Buchhaltung auch CRM, Marketing und Support brauchst, ist Zoho One unschlagbar im Preis-Leistungs-Verhältnis. Und mit der Hybrid-Strategie (bexio + Zoho One) bekommst du das Beste aus beiden Welten.

Meine Empfehlung: Überleg nicht nur, was du heute brauchst. Überleg, was dein Unternehmen in 12 Monaten braucht. Wenn die Antwort mehr als nur Buchhaltung ist, schau dir Zoho One an.

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